Allele distribution data for 16 short tandem repeat loci in Bolu

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0000-0003-0281-9389
dc.authorid0000-0003-2768-5946
dc.authorid0000-0002-1426-0247
dc.contributor.authorTuğ, Ayşim
dc.contributor.authorErkol, Zerrin
dc.contributor.authorÇetinyürek, Aysun
dc.contributor.authorAlakoç, Yeşim Doğan
dc.contributor.authorElma, Cüneyt
dc.contributor.authorBüken, Bora
dc.contributor.authorErkol, Hayri
dc.date.accessioned2021-06-23T18:40:24Z
dc.date.available2021-06-23T18:40:24Z
dc.date.issued2010
dc.departmentBAİBÜ, Tıp Fakültesi, Dahili Tıp Bilimleri Bölümüen_US
dc.departmentBAİBÜ, Tıp Fakültesi, Cerrahi Tıp Bilimleri Bölümü
dc.description.abstractAim: To examine the short tandem repeat (STR) data of Bolu population and compare the data with previously published population studies and with the data of a neighboring province, Düzce (a former district of Bolu), which became a province after the earthquake in 1999. Materials and methods: Blood samples were taken from 175 unrelated individuals. DNA was isolated using a DNA Kit and the amplification was performed using an AmpFℓSTR Identifier kit. Genotyping was carried out by an ABI Prism 310 genetic analyzer by using a reference ladder. Several parameters, such as allele frequencies, Hardy-Weinberg equilibrium, power of exclusion, power of discrimination, pairwise comparison, were calculated and correction test was used to confirm significant differences found in the comparative analysis. Results: According to their power of exclusion and power of discrimination values, the most discriminating loci were D18S51 and D2S1338 whereas TPOX appears to be the least. The most discriminating loci and paternity index were found to be different in Bolu and its former district, Düzce, which is an interesting result. Conclusion: The results indicate the importance of local population studies, because in regions where migration occurs and marriages between members of different ethnic groups are not socially acceptable, genetic data are affected.en_US
dc.description.abstractAmaç: Bu çalışmanın amacı, Bolu populasyonunda STR verilerini belirlemek, daha önce yapılmış populasyon çalışmaları ve önceden kendisine bağlı bir ilçe iken 1999 depreminden sonra il olan Düzce’nin verileri ile karşılaştırma yapmaktır. Yöntem ve gereç: Birbirleriyle akraba olmayan 175 kişinin kan örnekleri alınmıştır. DNA Kit kullanılarak DNAlar izole edilmiş ve AmpFℓSTR Identifier kit ile çoğaltılmıştır. ABI Prism 310 genetik analizörü ile referans dizi kullanılarak tiplendirme yapılmıştır. Allel sıklığı, Hardy Weinberg eşitliği, dışlama ve ayırt etme değerleri gibi farklı parametreler hesaplanmış ve karşılaştırmalı analizlerde belirgin farklılıkların doğruluğunun kontrolü için testler uygulanmıştır. Bulgular: Dışlama ve ayırım gücü değerlerine göre, D18S51 ve D2S1338 lokuslarının ayrım gücü en yüksek, TPOX lokusunun ise en düşük lokuslar olduğu belirlenmiştir. Bolu ile eski ilçesi Düzce’nin en ayırt edici lokus ve paternite indeksi açısından farklı özelliklere sahip olduğunun ortaya çıkarılması ilginç bir bulgu olmuştur. Sonuç: Elde edilen sonuçlar,özellikle göç yaşanan ve farklı etnik gruplar arasında kız alıp vermenin sosyal açıdan uygun görülmediği bölgelerde genetik verilerin etkilendiğini ve yerel populasyon çalışmalarının önemini göstermiştir.en_US
dc.identifier.endpage664en_US
dc.identifier.issn1300-0144
dc.identifier.issn1303-6165
dc.identifier.issue4en_US
dc.identifier.scopus2-s2.0-77958005861en_US
dc.identifier.scopusqualityQ3en_US
dc.identifier.startpage659en_US
dc.identifier.trdizinid106531en_US
dc.identifier.urihttps://app.trdizin.gov.tr/makale/TVRBMk5UTXhNUT09
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12491/3094
dc.identifier.volume40en_US
dc.identifier.wosWOS:000281832100022en_US
dc.identifier.wosqualityQ4en_US
dc.indekslendigikaynakWeb of Scienceen_US
dc.indekslendigikaynakScopusen_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.institutionauthorErkol, Zerrin
dc.institutionauthorBüken, Bora
dc.institutionauthorErkol, Hayri
dc.language.isoenen_US
dc.relation.ispartofTurkish Journal of Medical Sciencesen_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectDNA Analysisen_US
dc.subjectShort Tandem Repeats
dc.subjectPopulation Genetics
dc.subjectBolu
dc.subjectTurkey
dc.subjectDNA Analizi
dc.subjectKısa Ardışık Tekrarlar
dc.subjectPopulasyon Genetiği
dc.subjectBolu
dc.subjectTürkiye
dc.titleAllele distribution data for 16 short tandem repeat loci in Boluen_US
dc.title.alternativeBolu’da 16 otozomal STR lokusunun allel dağılımıen_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
aysim-tug.pdf
Boyut:
91.55 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam metin / Full text
İndir

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Cerrahi Tıp Bilimleri Bölümü Koleksiyonu
Dahili Tıp Bilimleri Bölümü Koleksiyonu
Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu