Allele distribution data for 16 short tandem repeat loci in Bolu

Yükleniyor...
Küçük Resim

Tarih

2010

Dergi Başlığı

Dergi ISSN

Cilt Başlığı

Yayıncı

Erişim Hakkı

info:eu-repo/semantics/openAccess

Özet

Aim: To examine the short tandem repeat (STR) data of Bolu population and compare the data with previously published population studies and with the data of a neighboring province, Düzce (a former district of Bolu), which became a province after the earthquake in 1999. Materials and methods: Blood samples were taken from 175 unrelated individuals. DNA was isolated using a DNA Kit and the amplification was performed using an AmpFℓSTR Identifier kit. Genotyping was carried out by an ABI Prism 310 genetic analyzer by using a reference ladder. Several parameters, such as allele frequencies, Hardy-Weinberg equilibrium, power of exclusion, power of discrimination, pairwise comparison, were calculated and correction test was used to confirm significant differences found in the comparative analysis. Results: According to their power of exclusion and power of discrimination values, the most discriminating loci were D18S51 and D2S1338 whereas TPOX appears to be the least. The most discriminating loci and paternity index were found to be different in Bolu and its former district, Düzce, which is an interesting result. Conclusion: The results indicate the importance of local population studies, because in regions where migration occurs and marriages between members of different ethnic groups are not socially acceptable, genetic data are affected.
Amaç: Bu çalışmanın amacı, Bolu populasyonunda STR verilerini belirlemek, daha önce yapılmış populasyon çalışmaları ve önceden kendisine bağlı bir ilçe iken 1999 depreminden sonra il olan Düzce’nin verileri ile karşılaştırma yapmaktır. Yöntem ve gereç: Birbirleriyle akraba olmayan 175 kişinin kan örnekleri alınmıştır. DNA Kit kullanılarak DNAlar izole edilmiş ve AmpFℓSTR Identifier kit ile çoğaltılmıştır. ABI Prism 310 genetik analizörü ile referans dizi kullanılarak tiplendirme yapılmıştır. Allel sıklığı, Hardy Weinberg eşitliği, dışlama ve ayırt etme değerleri gibi farklı parametreler hesaplanmış ve karşılaştırmalı analizlerde belirgin farklılıkların doğruluğunun kontrolü için testler uygulanmıştır. Bulgular: Dışlama ve ayırım gücü değerlerine göre, D18S51 ve D2S1338 lokuslarının ayrım gücü en yüksek, TPOX lokusunun ise en düşük lokuslar olduğu belirlenmiştir. Bolu ile eski ilçesi Düzce’nin en ayırt edici lokus ve paternite indeksi açısından farklı özelliklere sahip olduğunun ortaya çıkarılması ilginç bir bulgu olmuştur. Sonuç: Elde edilen sonuçlar,özellikle göç yaşanan ve farklı etnik gruplar arasında kız alıp vermenin sosyal açıdan uygun görülmediği bölgelerde genetik verilerin etkilendiğini ve yerel populasyon çalışmalarının önemini göstermiştir.

Açıklama

Anahtar Kelimeler

DNA Analysis, Short Tandem Repeats, Population Genetics, Bolu, Turkey, DNA Analizi, Kısa Ardışık Tekrarlar, Populasyon Genetiği, Bolu, Türkiye

Kaynak

Turkish Journal of Medical Sciences

WoS Q Değeri

Q4

Scopus Q Değeri

Q3

Cilt

40

Sayı

4

Künye