Identification, distribution and genetic diversity of Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923) Skarbilovich, 1959 (Tylenchida: Heteroderidae) populations in Turkey

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0000-0002-3385-2520en_US
dc.authorid0000-0002-7217-9092
dc.contributor.authorAltaş, Ahmet
dc.contributor.authorEvlice, Emre
dc.contributor.authorÖzer, Göksel
dc.contributor.authorDababat, Abdelfattah
dc.contributor.authorİmren, Mustafa
dc.date.accessioned2021-06-23T19:54:47Z
dc.date.available2021-06-23T19:54:47Z
dc.date.issued2020
dc.departmentBAİBÜ, Ziraat Fakültesi, Bitki Koruma Bölümüen_US
dc.description.abstractThe golden nematode, Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923) Skarbilovich, 1959 (Tylenchida: Heteroderidae) is one of the most economically important pests of potato in the world. Tests for this nematode are routinely performed for outbreaks and densities in potato growing areas. The morphological and molecular analyses for precise determination of the nematode are employed to establish appropriate management strategies. This study showed that 96% of soil samples obtained from Bozdag and Odemis Districts of Izmir Province, during 2017 and 2018 potato growing seasons, were positive for G. rostochiensis. The mean number of cysts ranged from 0.01 to 3.70 cysts g(-1) soil in the fields examined. The examination of the morphological and morphometric features of the second-stage juveniles and cysts of the G. rostochiensis revealed slight differences among the populations obtained from Bozdag and Odemis. To assess the accuracy of the identification, partial sequences of ribosomal DNA for all populations were amplified, sequenced, and deposited in GenBank. The comparisons of the sequences with those of corresponding G. rostochiensis populations available in GenBank showed 99.89-100% nucleotide similarity. The results of this study will help to better understand the physiology, ecology and biology of the nematode to quarantine this pest more effectively.en_US
dc.description.abstractAltın nematod, Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923) Skarbilovich, 1959 (Tylenchida: Heteroderidae) dünyada ekonomik açıdan en önemli patates zararlılarından birisidir. Genellikle patates yetiştirilen alanlarındaki dağılımları ve yoğunluklarını belirlemek amacıyla bu nematod için rutin olarak testler gerçekleştirilmektedir. Morfolojik ve moleküler analizler bu nematodun kesin tanısını yapmak ve mücadele stratejilerini oluşturmak amacıyla kullanılmaktadır. Bu çalışma, İzmir İli’nin Bozdağ ve Ödemiş ilçelerinden 2017 ve 2018 yılları patates yetiştiriciliği sezonlarında alınan toprak örneklerinin %96'sının G. rostochiensis ile enfekte olduğunu göstermiştir. Bulaşık alanlardaki ortalama kist sayısı, 0.01 ila 3.70 kist g-1 toprak arasında değişmiştir. Globodera rostochiensis'in ikinci dönem larva ve kistlerinin morfolojik ve morfometrik karakterlerinin incelenmesi, Bozdağ ve Ödemiş’ten elde edilen popülasyonlarda arasındaki hafif farklılıkları ortaya koymuştur. Tanımlamanın doğruluğunu değerlendirmek için, tüm popülasyonlar için kısmi ribozomal DNA sekansları amplifiye edilmiş, sekanslanmış ve GenBank veritabanına kaydedilmiştir. Morfolojik ölçümler ve filogenetik analizler sonucunda Bozdağ ve Ödemiş'ten elde edilen popülasyonlar arasında küçük farklılıkların olduğu belirlenmiştir. Sekansların GenBank'ta mevcut karşılık gelen G. rostochiensis popülasyonlarıyla karşılaştırılması sonucunda nükleotid benzerliği %99.89-100 oranında görülmüştür. Bu çalışmanın sonuçları, bu zararlıyı daha etkili bir şekilde karantinaya almak için nematodun fizyolojisini, ekolojisini ve biyolojisini daha iyi anlamaya yardımcı olacaktır.
dc.identifier.doi10.16970/entoted.740223
dc.identifier.endpage397en_US
dc.identifier.issn1010-6960
dc.identifier.issue3en_US
dc.identifier.scopus2-s2.0-85108648899en_US
dc.identifier.scopusqualityQ3en_US
dc.identifier.startpage385en_US
dc.identifier.trdizinid405542en_US
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.16970/entoted.740223
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12491/10648
dc.identifier.volume44en_US
dc.identifier.wosWOS:000555419900010en_US
dc.identifier.wosqualityQ4en_US
dc.indekslendigikaynakWeb of Scienceen_US
dc.indekslendigikaynakScopusen_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.institutionauthorÖzer, Göksel
dc.institutionauthorİmren, Mustafa
dc.language.isoenen_US
dc.publisherEntomological Soc Turkey, Ege Univen_US
dc.relation.ispartofTurkiye Entomoloji Dergisi-Turkish Journal Of Entomologyen_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectGlobodera Rostochiensisen_US
dc.subjectITSen_US
dc.subjectIzmiren_US
dc.subjectMorphologyen_US
dc.subjectPhylogenyen_US
dc.subjectGlobodera Rostochiensis
dc.subjectITS
dc.subjectİzmir
dc.subjectMorfoloji
dc.subjectFilogenetik
dc.titleIdentification, distribution and genetic diversity of Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923) Skarbilovich, 1959 (Tylenchida: Heteroderidae) populations in Turkeyen_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
ahmet-altas.pdf
Boyut:
2.65 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin/Full Text
İndir

Koleksiyon

WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Bitki Koruma Bölümü Koleksiyonu
Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu