Yazar "Çakir, Ibrahim" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 5 / 5
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    EFFECT OF BACTERIAL CELLULOSE AS A FAT REPLACER ON SOME QUALITY CHARACTERISTICS OF FAT REDUCED SUCUK
    (2015) Akoğlu, Aylin; Çakir, Ibrahim; Akoğlu, Ilker Turan; Karahan, Aynur Gül; Çakmakçi, M.Lütfü
    Bu çalışmada Gluconacetobacter sp. A06O2 suşundan elde edilen bakteriyel selüloz (BS) sucukta yağ ikame maddesi olarak kullanılmış ve sucuğun bazı kalite özellikleri üzerine etkisi araştırılmıştır. Yağ seviyesi azaldıkça ve BS miktarı arttıkça sucuk örneklerinin nem ve protein değerlerinin arttığı tespit edilmiştir. BS ilavesi sertlik değerine etki ederken, yapışkanlık ve çiğnenebilirdik değerlerine etki etmemiştir. Yağ içeriğindeki azalış a ve b değerlerinin artışına L değerinin azalışına neden olmuştur (P > 0.05). Tat, koku, renk, tekstür ve genel beğeni açısından örnekler arasında önemli bir farklılık tespit edilmemiştir (P > 0.05). Bu sonuçlar yağı azaltılmış fermente sucuk üretiminde bakteriyel selülozun yağ ikame maddesi olarak kullanılabileceğini göstermiştir.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Farklı Gıdalardan İzole Edilmiş Yerel Maya Suşlarının Türler Arası ve Tür İçi Genetik Farklılıkların iPBSRetrotranspozon Markörleri ile İncelenmesi ve MALDITOF- MS Biotyper Sistemi ile Hızlı ve Kesin Tanısı
    (2020) Çakir, Ibrahim; Aydin, Furkan; Özer, Göksel
    Mayalar, gıda endüstrisindeki önemli mikroorganizma gruplarından biri olmakla birlikte birçok ekosistemin önemli bilesenlerindendir. Maya tür ve suslarının tanımlama yöntemi oldukça önemlidir. Bu yüzden bu yöntemlerin basit, güvenilir, hızlı ve düsük maliyetli olması gerekmektedir. Bu çalısma kapsamında öncelikle farklı fermente gıda ürünlerinden izole edilmis 8 farklı türe ait 112 adet maya susunun tür içi ve türler arası genetik karakterizasyonu dünyada ilk defa olmak üzere iPBS retrotranspozon markör sistemi ile gerçeklestirilmistir. Ikinci olarak izolatlar alternatif bir yöntem olan MALDI TOF MS yöntemi ile de tanımlanmıstır. Olusan farklı grupların moleküler tanımlaması 26S rRNA bölgesinin D1/D2 alt bölgesinin sekanslanmasıyla gerçeklestirilmistir. Çalısmada kullanılan 8 adet iPBS primeri tarafından primer basına ortalama 34.75 olmak üzere toplamda 278 adet polimorfik bant üretilmistir. iPBS markör sistemi için belirlenen Polymorphic Information Content (Polimorfik Bilgi Içerigi:PIC) ile resolving power (Çözünürlük Gücü: RP) sırasıyla 0.23 ve 10.11 olarak tespit edilmistir. Maya türleri için elde edilen genetik parametreler; polimorfik bölgelerin yüzdesi %19.23-%71.21, Nei'nin gen çesitliligi 0.085-0.228, Shannon'ın bilgi endeksi degerleri 0.125 ie 0.349 arasında degiskenlik gösterdigi görülmüstür. Düsük gen akısı degeri (0.09) izolatlar arasındaki genetik farklılıgın (0.85) özellikle türler arasındaki farklılıklardan kaynaklandıgını ortaya koymaktadır. UPGMA analizleri türler arasındaki olusan varyasyona göre maya suslarını farklı gruplar altında toplamıs olup türler arasında önemli derecede genetik farklılık oldugunu göstermistir. Çalısmada degerlendirilen sekiz primerin herbirisi türleri ayırmada yeterli ayrım gücünü göstermistir. Bu çalısma bulguları iPBS yönteminin gıda kaynaklı mayaların tanımlanmasında ve genetik karakterizasyonunda kullanılabilir oldugunu göstermektedir. Izolatların MALDI-TOF-MS sonuçları degerlendirildiginde, hızlı ekstraksiyon ile tam ekstraksiyon arasında istatiksel olarak anlamlı fark bulunmus olup (p küçük 0.05) tam ekstraksiyon ile gerçeklestirilen MALDI-TOF-MS tanımlamasının daha iyi sonuçlar verdigi görülmüstür. MALDI-TOF-MS yönteminin farklı gıda materyallerinden izole edilen mayaların tanımlanmasında yararlı olabilecegi görülmüstür. Son olarak, bu çalısma endüstriyel öneme sahip olan maya tür ve suslarının tanımlanma metodolojisi ve populasyon genetigi ile ilgili daha ileri çalısmalar için bir ön çalısma niteligi tasımaktadır
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    GELENEKSEL YOĞURTLARDAN İZOLE EDİLEN LAKTİK ASİT BAKTERİLERİNİN MALDI TOF MS BİOTYPER SİSTEMİ İLE TANIMLANMASI VE BAZI STARTER KÜLTÜR ÖZELLİKLERİNİN BELİRLENMESİ
    (2022) Encu, Şeyma Betül; Soykut, Esra Acar; Çakir, Ibrahim
    Bu çalışmada Batı Karadeniz Bölgesi’nde, beş ilden toplanan, geleneksel yöntemlerle üretilmiş yoğurtlardan laktik asit bakterilerinin izolasyonu, tanımlanması, bazı starter kültür özelliklerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Suşların tanımlanması MALDI-TOF MS Biotyper sistemi ile gerçekleştirilmiştir. İzole edilen 84 izolattan 2’si Lactobacillus helveticus, 2’si Lactiplantibacillus plantarum, 3’ü Limosilactobacillus fermentum, 1’i Enterococcus faecalis ve 76’sı Lactobacillus delbrueckii olarak tanımlanmıştır. İzolatların eritromisin, teikoplanin, streptomisin, rifampisin, amfisilin, klindamisin, sefotaksim, kloramfenikol, tetrasiklin ve vankomisine karşı duyarlı, nalidiksik asit, siprofloksasin, ofloksasin, gentamisin ve trimethoprim sülfametoksazole karşı dirençli oldukları tespit edilmiştir. İzolatların Salmonella Typhimurium ve E. coli O157:H7’ye karşı antimikrobiyal etki gösterdiği ancak Bacillus cereus, Listeria monocytogenes ve Staphylococcus aureus’a karşı antimikrobiyal etkisinin düşük olduğu tespit edilmiştir. İzolatlardan 8’inin ürettiği asitliğin %0.9 ve 0.95 arasında olduğu bulunmuştur. Ayrıca 74 izolatın diasetil üretimi gerçekleştirdiği belirlenmiştir. Starter olma potansiyeli yüksek 26 suşun proteinaz aktivitesi ve fajlara karşı direnç durumu incelenmiştir. Suşlardan 5’inin proteolitik aktivite göstermediği ve faj direnci testi sonuçlarına göre izolatlardan 8 tanesi ?709-X1 fajına karşı duyarlı olup, 12 adet Lactobacillus delbrueckii izolatının ise çalışmada kullanılan 15 farklı bakteriyofaja karşı dirençli oldukları belirlenmiştir. Çalışma sonuçlarına göre izole edilen kültürlerin incelenen özellikler açısından starter kültür olarak kullanılabilme potansiyeline sahip oldukları belirlenmiştir.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    TAZE DİLİMLENMİŞ MEYVELERDE SALMONELLA TYPHIMURIUM’UN FAJLARLA BİYOKONTROLÜ
    (2024) Encu, Şeyma Betül; Yildirim, Aslı; Akbaş, Selin; Çakir, Ibrahim; Soykut, Esra Acar
    Gıda kaynaklı hastalıklar dünya çapında halk sağlığı açısından büyük bir sorun olarak varlığını sürdürmektedir. Mikrobiyel kaynaklı gıda zehirlenmelerinin başında ise patojenik Salmonella serotipleri gelmektedir. Bu çalışmada dilimlenmiş meyvelerde de rastlanan Salmonella Typhimurium’un fajlar ile inhibisyonu hedeflenmiştir. Bunun için atık su, çiğ süt ve tavuk eti örneklerinden izole edilen Salmonella Typhimurium fajlarının EcoRV ve XbaI enzimleri ile RFLP analizi yapılmış 9 fajdan 4’ünün genomik olarak birbirinden farklı olduğu tespit edilmiştir. Tek aşamalı gelişme eğrileri çıkarılan bu fajların latent dönemleri kısa (5-15 dk), patlama büyüklükleri ise 25-111 PFU/hücre aralığında bulunmuştur. Fajların farklı cins bakterilere karşı litik etkisi incelenmiş fakat Salmonella dışındaki Gram pozitif ve Gram negatif bakterilere karşı litik etkisi saptanmamıştır. Fajlardan hazırlanan kokteyl ile kavunda S. Typhimurium sayısında MOI 1000 ve 10000 değerlerinde 2 log KOB/g azalış; ananas örneklerinde ise MOI 10 ve 100 değerlerinde 1 log KOB/g azalış tespit edilmiştir. Hazırlanan faj kokteylinin gıda endüstrisinde Salmonella kontrolü için kullanılabilecek stratejiler arasında olabileceği ortaya konmuştur.