Bursa ve Bilecik illeri şeftali yetiştiriciliği yapılan alanlarda prune dwarf virus (PDV) yaygınlığı ve genetik çeşitliliği

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0000-0002-5836-8030
dc.authorid000-0002-0557-6119
dc.contributor.authorÇelik, Ali
dc.contributor.authorErtunç, Filiz
dc.date.accessioned2021-06-23T18:42:44Z
dc.date.available2021-06-23T18:42:44Z
dc.date.issued2020
dc.departmentBAİBÜ, Ziraat Fakültesi, Bitki Koruma Bölümüen_US
dc.description.abstractPrune dwarf virus (PDV), sert çekirdekli meyve ağaçlarının önemli viral patojenleri arasında yer almaktadır. Bu çalışmada Türkiye’nin önemli şeftali üretiminin yapıldığı Bursa ve Bilecik illerinde ilk kapsamlı PDV enfeksiyonu araştırılmıştır. 460 viral simptom şüphesi ile toplanan şeftali yaprağı DAS-ELISA testine tabi tutulmuş ve 19 örneğin (%4.13) PDV ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. Yapılan RT-PCR çalışmaları sonucunda virüsün kılıf protein bölgesine ait 862 bp uzunluğunda nükleotid dizileri elde edilmiş, elde edilen diziler GenBank’ta kayıtlı Türkiye ve dünya PDV referans izolatları ile karşılaştırılmıştır. Yapılan BLASTn analizi sonucunda PDV şeftali Türkiye izolatları, referans PDV sekans verileri ile nükleotid düzeyinde %87.77-97.56 arasında benzerlik göstermiştir. Nükleotid dizi bilgisi elde edilen izolatların filogenetik analiz çalışmaları ile, dünya ve Türkiye izolatları ile ilişkisi belirlenmiştir. Araştırma bulguları coğrafik orijin ve farklı Prunus türlerinden izole edilen PDV izolatları arasında herhangi bir filogenetik ilişkinin olmadığını göstermiştir. Çalışma sonucunda ilk kez ülkemizde şeftali PDV izolatlarının kılıf protein bölgesine ait nükleotid dizileri elde edilmiştir.en_US
dc.description.abstractPrune dwarf virus (PDV) is one of the important viral pathogens of stone fruits. In this study, PDV infection was investigated extensively for the first time in Bursa and Bilecik provinces, which have large peach production areas of Turkey. Four hundred-sixty peach leaves showing viral symptoms were subjected to DAS-ELISA test and 19 samples (%4.13) were found to be infected with PDV. As a result of RT-PCR studies, 862 bp length nucleotide sequences of the coat protein region of the virus genome were obtained and compared with reference isolates in the GenBank. Sequence comparisons showed 87.77-97.56% nucleotide identity. The genetic relationship was determined by phylogenetic analysis of Turkey and world isolates of PDV. The results of the study showed that there was no phylogenetic relationship between geographic origin and PDV isolates from different Prunus species. As a result of this study, nucleotide sequences of the coat protein regions of PDV isolates from peach were obtained for the first time in our country.en_US
dc.identifier.endpage74en_US
dc.identifier.issn2149-8245
dc.identifier.issue1en_US
dc.identifier.startpage66en_US
dc.identifier.trdizinid360129en_US
dc.identifier.urihttps://app.trdizin.gov.tr/makale/TXpZd01USTVPUT09
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12491/3669
dc.identifier.volume6en_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.institutionauthorÇelik, Ali
dc.institutionauthorErtunç, Filiz
dc.language.isotren_US
dc.relation.ispartofUluslararası Tarım ve Yaban Hayatı Bilimleri Dergisi (UTYHBD)en_US
dc.relation.ispartofInternational Journal of Agriculture and Wildlife Science (IJAWS)
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectBursaen_US
dc.subjectBilecik
dc.subjectŞeftali
dc.subjectPDV
dc.subjectEnfeksiyon
dc.subjectBursa
dc.subjectBilecik
dc.subjectPeach
dc.subjectPDV
dc.subjectİnfection
dc.titleBursa ve Bilecik illeri şeftali yetiştiriciliği yapılan alanlarda prune dwarf virus (PDV) yaygınlığı ve genetik çeşitliliğien_US
dc.title.alternativeDistribution and genetic diversity of prune dwarf virus (PDV) in peach growing areas in Bursa and Bilecik provincesen_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
ali-celik.pdf
Boyut:
620.58 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam metin / Full text
İndir

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Bitki Koruma Bölümü Koleksiyonu
Uluslararası Tarım ve Yaban Hayatı Bilimleri Dergisi Koleksiyonu