Van gölü havzasından toplanan terslale (Fritillaria imperialis L.) genotiplerinde genetik farklılığın iPBS retrotranspozon markırları ile belirlenmesi

dc.authorid0000-0002-7470-0080
dc.authorid0000-0002-8109-5245
dc.authorid0000-0002-1076-3648
dc.authorid0000-0002-9552-4848
dc.authorid0000-0001-6534-5286
dc.contributor.authorKoçak, Metin
dc.contributor.authorKarataş, Merve Dilek
dc.contributor.authorAlp, Şevket
dc.contributor.authorBaloch, Faheem Shehzad
dc.contributor.authorYıldız, Mehtap
dc.date.accessioned2021-06-23T18:57:28Z
dc.date.available2021-06-23T18:57:28Z
dc.date.issued2020
dc.departmentBAİBÜ, Ziraat Fakültesi, Tarla Bitkileri Bölümüen_US
dc.description.abstractFritillaria imperialis L. naturally grows in Turkey and it is used as an ornamental plant. This species harbored plentiful genetic variation for various morphological traits in its natural habitat. In this study, 19 different iPBS-Retrotransposon primers were used to identify genetic variation among 74 F. imperialis genotypes collected around Van lake basin. 19 primers amplified 94 bands, 100% polymorphism. The average number of bands per primer was 4.94 and the average polymorphism information content (PIC) was 0.58. Maximum number of polymorphic bands were 10 while the minimum number of polymorphic bands were 2. The mean effective number of alleles, Shannon information index and the gene diversity were 1.50, 0.47, and 0.30 respectively. The results reflected that genetic variations of F. imperialis genotypes collected from Van lake basin were significant. This is the first report identifying the genetic variations of F. imperialis genotypes by iPBS-Retrotransposon primers, and it proved that iPBS-Retrotransposon marker system could be applied successfully in F. imperialis for genetics and genomic studies. The data obtained from this study will provide preliminary information for future F. imperialis breeding activities.en_US
dc.description.abstractFritillaria imperialis L. (Terslale) Türkiye’de doğal olarak yetişen ve süs bitkisi olarak kullanılan bir türdür. Bu tür doğada morfolojik olarak yüksek bir genetik varyasyon göstermektedir. Van Gölü havzasından toplanan 74 F. imperialis genotipi arasındaki genetik çeşitliliği belirlemek amacıyla yürütülen bu çalışmada, 19 farklı iPBS-Retrotranspozon primeri kullanılmıştır. Kullanılan 19 primerin tamamı %100 oranında polimorfizm gösteren toplam 94 bant oluşturmuştur. Primer başına düşen ortalama bant sayısının 4.94, ortalama polimorfizm bilgi içeriğinin (PIC) ise 0.58 olduğu belirlenmiştir. En düşük bant veren primer 2 bant oluştururken, en yüksek bant veren primer 10 bant oluşturmuştur. Ortalama etkili allel sayısının 1.50, Shannon bilgi indeksinin 0.47, gen çeşitliliğinin ise 0.30 olduğu saptanmıştır. Elde edilen sonuçlar, Van Gölü havzasından toplanan ters lale genotiplerindeki genetik farklılığın önemli düzeyde olduğunu ortaya koymuştur. Terslale genotiplerinde ilk kez iPBS-Retrotranspozon markırları kullanılarak genetik çeşitliliğin belirlenmesine yönelik olarak yürütülen bu çalışma, iPBS-Retrotranspozon markır sisteminin bu türde başarılı bir şekilde uygulanabileceğini ortaya koymuştur. Elde edilen veriler, terslale üzerinde yürütülecek ıslah çalışmaları için ön bilgi oluşturacak niteliktedir.
dc.identifier.doi10.29133/yyutbd.705721
dc.identifier.endpage406en_US
dc.identifier.issn1308-7576
dc.identifier.issue2en_US
dc.identifier.scopus2-s2.0-85086669628en_US
dc.identifier.scopusqualityQ3en_US
dc.identifier.startpage398en_US
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.29133/yyutbd.705721
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12491/5196
dc.identifier.volume30en_US
dc.indekslendigikaynakScopusen_US
dc.institutionauthorBaloch, Faheem Shehzad
dc.language.isotren_US
dc.publisherCentenary Universityen_US
dc.relation.ispartofYuzuncu Yil University Journal of Agricultural Sciencesen_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectFritillaria Imperialisen_US
dc.subjectGenetic Diversityen_US
dc.subjectIPBS-retrotransposonsen_US
dc.subjectGenetik Varyasyon
dc.subjectiPBS-Retrotranspozon
dc.titleVan gölü havzasından toplanan terslale (Fritillaria imperialis L.) genotiplerinde genetik farklılığın iPBS retrotranspozon markırları ile belirlenmesien_US
dc.title.alternativeIdentification of genetic variations on fritillaria imperialis L. Genotypes collected from Van Lake Basin by iPBS-retrotranspozon markersen_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Yükleniyor...
Küçük Resim
İsim:
metin-kocak.pdf
Boyut:
516.89 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam metin/ Full text