Yazar "Bulut, Burak" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Meta analysis of RNA-Seq data for sugar beet (Beta vulgaris L.) under certain biotic and abiotic stresses
    (Bolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi, 2022) Bulut, Burak; Gürel, Songül; Ünlü, Ercan Selçuk
    Şeker pancarı (Beta vulgaris) dünya şeker üretiminin %30'unu karşılamaktadır. Üretim alanlarındaki toprak kirliliği, biyotik ve abiyotik faktörler, ürün miktarını ve kalitesini büyük ölçüde düşürür. Bu stres koşulları kuraklık, tuz, ısı, ışık, nematod, bakteri ve mantar enfeksiyonlarıdır. Şeker pancarı, biyotik ve abiyotik streslere farklı tepkiler verir. Beta vulgaris'in strese tepkisini moleküler düzeyde anlamak, mahsulde hem verimi hem de kaliteyi artırmaya yardımcı olabilir. Stres koşulları altında yapılan transkriptom çalışmaları, bitkilerin moleküler düzeydeki tepkilerine ışık tutabilir. Bu çalışmada dört farklı stres durumu verisi kullanılmıştır. Bunlardan ikisi biyotik stresler (nematod ve mantar enfeksiyonu), ikisi abiyotik streslerdir (ABA tedavisi ve tuz stresi). Meta-analiz, farklı stres koşulları altında ortak tepkiler bulmaya yardımcı olabilir. Bu çalışmada, biyotik ve abiyotik stres koşulları altında yürütülen çalışmaların meta-analizini gerçekleştirdik ve hem biyotik hem de abiyotik stres koşullarında farklı şekilde ifade edilen on geni ortaya çıkardık. Biyotik streslerin 460 ortak geni ve abiyotik streslerin 1031 stresle ilgili geni vardır. Fenofitinazın aşağı regülasyonu ve mannitol dehidrojenazın yukarı regülasyonu, artan fotosentez hızının göstergesi olabilir. Bununla birlikte, genlerin tanımlanması ve B. vulgaris stres yanıtının tüm mekanizmasının anlaşılması için daha ileri çalışmalara ihtiyaç vardır.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Meta-analysis of sugar beet (Beta vulgaris L.) transcriptome profiles under different biotic and abiotic stress conditions
    (Springer, 2023) Bulut, Burak; Gürel, Songül; Ünüvar, Ömer Can; Gürel, Ekrem; Ünlü, Ercan Selçuk
    Sugar beet (Beta vulgaris L.) meets the 21% of world sugar production. Soil pollution, biotic and abiotic factors in production areas greatly reduce product quantity and quality. Sugar beet responds to biotic and abiotic stresses such as drought, salt, heat, light, and infections of nematode, bacteria and fungi at the molecular level. Understanding molecular mechanisms require comprehensive genomics studies in order to control these mechanisms to increase the yield and quality. Transcriptome studies performed under stress conditions can shed light on the responses of plants at the molecular level. In addition, meta-analysis can help to find common responses under different stress conditions. In this study four different stress-related transcriptome data were used: two of them are related with biotic stress (nematode and fungi infection) and two of them are related with abiotic stress (ABA treatment and salt stress). In this study, we performed meta-analysis of studies conducted under biotic and abiotic stress conditions. Our results revealed 460 commonly regulated genes from biotic stress related data and 1031 commonly regulated genes from abiotic stress related data. Our data also showed that expression of ten genes is controlled regardless of the type of stress condition. The data can be useful for understanding the molecular aspect of adaptive stress response in sugar beet.