Yazar "Ba, Ndeye Mareme" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 4 / 4
  • Küçük Resim
    Öğe
    Critical F129 and L138 in loop III of bile salt hydrolase (BSH) in Lactobacillus plantarum B14 are essential for the catalytic activity and substrate specificity
    (Taylor & Francis Inc, 2019) Öztürk, Mehmet; Önal, Cansu; Ba, Ndeye Mareme
    Bile salt hydrolase (BSH) is a gut-bacterial enzyme that influences human health by altering the host fat digestion and cellular energy generation. BSH is essential for deconjugation of the glycine or taurine-conjugated bile salts in the small intestine of humans. Therefore, BSH may be a key microbiome target for the designing of new measures to control some diseases in humans. BSHs, a member of the N-terminal nucleophile (Ntn) hydrolase superfamily, exhibit higher variation in substrate specificity. The phenylalanine-129 (F129) and leucine-138 (L138) in loop III of BSH, thought to be responsible for substrate specificity, are partially conserved in this superfamily. In this study, the aromatic-hydrophobic F129 and aliphatic-hydrophobic L138 of C-terminally His-tagged BSH from Lactobacillus plantarum B14 (LbBSH) was substituted for aliphatic-hydrophobic isoleucine (I) and negatively charged polar glutamate (E) amino acid, respectively, by site-directed mutagenesis and characterized using an Escherichia coli BLR(DE3) expression system. Although both mutations resulted in an assembled and stable recombinant BSHs (rBSHs), they altered the catalytic activity and substrate specificity of rBSH. This is the first experimental finding which confirmed that F129 and L138 were critical amino acids for the catalytic activity and substrate specificity turnover of BSH.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Functional characterization of Val58Met and Phe129Ile mutants of bile salt hydrolase from Lactobacillus plantarum in E. coli BLR(DE3) strain
    (Wiley-Blackwell, 2016) Öztürk, Mehmet; Önal, Cansu; Kılıçsaymaz, Zekiye; Ba, Ndeye Mareme
    [No Abstract Available]
  • Küçük Resim
    Öğe
    Molecular cloning and characterization of bile salt hydrolase from lactobacillus gasseri atcc 33323 strain
    (Taylor & Francis Inc, 2018) Ba, Ndeye Mareme; Öztürk, Mehmet
    Bile salt hydrolase (BSH) active probiotic strains are being used in the treatment of hypercholesterolemia related diseases. Understanding the mechanism of action of the BSH of probiotics is crucial. Even though Lactobacillus gasseri is probably one of the most beneficial probiotics on the market, there is no information on the catalytic activity and substrate preferences of its BSH. This study aims to detect the substrate specificity of the BSH of Lb. gasseri ATCC 33323 strain, to determine the optimum temperature and pH of the BSH's activity by ninhydrin assay. To do so, the BSH gene from Lb. gasseri ATCC 33323 was cloned into Escherichia coli XL1-Blue strain, expressed and characterized in E. coli BLR(DE3). Results indicated that even though the recombinant BSH (rBSH) was able to hydrolyze the six major human bile salts, there was an obvious preference for the glycine-conjugated bile salts and the maximum activities of the rBSH were recorded.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Molecular cloning, characterization and comparison of bile salt hydrolase enzyme from Lactobacillus gasseri
    (Bolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi, 2016) Ba, Ndeye Mareme; Öztürk, Mehmet; Ermurat, Yakup
    Geçtiğimiz on yıl içinde, aktif safra tuzu hidrolaz (STH) enzimi taşıyan probiyotikler hiperkolesterolemi temelli hastalıkların tedavisinde kullanılmaktadır. BSH enziminin safra tuzlarını sebest safra asitlerine ve glisin veya taurin amino asitlerine dönüştürme yeteneği, bu STH enziminin probiyotik seçiminde önemli bir kriter oluşturmaktadır. Bu dekonjugasyon sadece bakterilerin gastro intestinal sistemde hayatta kalabilmesi için tolerans sağlamaz, aynı zamanda insan konakçısının kan kolesterol düzeyinin azaltılmasında önemli bir rol oynar. Bu nedenle, tedavilerde kullanılan probiyotiklerin ve safra tuzu hidrolaz enzimlerin etki mekanizmasının bilinmesi ve anlaşılması önemlidir. Lactobacillus gasseri muhtemelen piyasadaki en yararlı probiyotiklerden biri olsa da, bu mikroorganizmanın STH enziminin katalitik aktivitesi ve substrat tercihleri etki mekanizması ile ilgili çok az bilgi bulunmaktadır. Bu çalışmada, Lb.gasseri ATCC 33323 suşundan elde edilen sth geninin Escherichia coli BLR(DE3) suşuna klonlanmış, ifade edilmiş ve tanımlanmış. Bu yaban tip rekombinan STH (yrSTH) enzimin hidroliz aktivitesi 25°C ile 65°C arasında değişen farklı sıcaklıklarda ve 4.0 ile 8.0 pH aralıklarında yapılan altı farklı safra tuzunun kullanıldığı ninhydrin testleri araştırlmıştır. Yrsth geminin ifadesi ise SDS-PAGE ile belirlenmiştir. Ninhidrin test sonuçları, yrSTH enziminin altı temel insan safra tuzunu hidroliz etmekle birlikte taurine ekli tuzlardan ziyade glisin ekli tzları daha fazla tercih ettiklerrini göstermektedir. yrBSH enziminin maksimum aktiviteleri düşük pH ve yüksek sıcaklıklarda kaydedildi. Elde edilen bulgular, STH enzimleri substratlarını kolat ekinden ziyade aminoasit eklerine göre tanımaktadır önerisini desteklemektedir. Bununla birlikte, STH enziminin katalitik aktivitesi, substrat özgüllükleri ve probiyotk bakteri seçi kriterlerinin daha iyi anlaşılması için yönlendirilmiş mutagenez gibi daha genişletilmiş çalışmalara ihtiyaç duyulmaktadır. ANAHTAR KELİMELER: Probiyotik, Lactobacillus gasseri, Safra tuzu hidrolaz (STH), Katalitik aktivite ve Sübstrat özgüllüğü